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1. (WO2018111914) METHODS FOR ASSEMBLING DNA MOLECULES
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Veröff.-Nr.: WO/2018/111914 Internationale Anmeldenummer PCT/US2017/065877
Veröffentlichungsdatum: 21.06.2018 Internationales Anmeldedatum: 12.12.2017
IPC:
C12N 15/09 (2006.01) ,C12N 15/10 (2006.01) ,C12P 19/34 (2006.01)
C Chemie; Hüttenwesen
12
Biochemie; Bier; Spirituosen; Wein; Essig; Mikrobiologie; Enzymologie; Mutation oder genetische Techniken
N
Mikroorganismen oder Enzyme; Zusammensetzungen aus Mikroorganismen oder Enzymen; Züchten, Konservieren oder Lebensfähigerhalten von Mikroorganismen; Mutation oder genetische Verfahrenstechnik; Kulturmedien
15
Mutation oder genetische Verfahrenstechnik; DNA oder RNA, die genetische Verfahrenstechnik betreffend, Vektoren, z.B. Plasmide, oder ihre Isolierung, Herstellung oder Reinigung; Gebrauch von Wirten hierfür
09
Rekombinante DNA-Technologie
C Chemie; Hüttenwesen
12
Biochemie; Bier; Spirituosen; Wein; Essig; Mikrobiologie; Enzymologie; Mutation oder genetische Techniken
N
Mikroorganismen oder Enzyme; Zusammensetzungen aus Mikroorganismen oder Enzymen; Züchten, Konservieren oder Lebensfähigerhalten von Mikroorganismen; Mutation oder genetische Verfahrenstechnik; Kulturmedien
15
Mutation oder genetische Verfahrenstechnik; DNA oder RNA, die genetische Verfahrenstechnik betreffend, Vektoren, z.B. Plasmide, oder ihre Isolierung, Herstellung oder Reinigung; Gebrauch von Wirten hierfür
09
Rekombinante DNA-Technologie
10
Prozesse für die Isolierung, Herstellung oder Reinigung von DNA oder RNA
C Chemie; Hüttenwesen
12
Biochemie; Bier; Spirituosen; Wein; Essig; Mikrobiologie; Enzymologie; Mutation oder genetische Techniken
P
Gärungsverfahren oder Verfahren unter Verwendung von Enzymen zur gezielten Synthese von chemischen Verbindungen oder Zusammensetzungen oder zur Trennung optischer Isomerer aus einer racemischen Mischung
19
Herstellung von Verbindungen, die Saccharidreste enthalten
26
Herstellung von Stickstoff enthaltenden Kohlenhydraten
28
N-Glycoside
30
Nucleotide
34
Polynucleotide, z.B. Nucleinsäuren, Oligoribonucleotide
Anmelder:
SYNTHETIC GENOMICS, INC. [US/US]; 11149 North Torrey Pines Road, Suite 100 La Jolla, CA 92037, US
Erfinder:
GILL, John, E.; US
GIBSON, Daniel, G.; US
FU, Lixia; US
Vertreter:
HAILE, Lisa, A.; US
HIERHOLZER, Matthew, J.; US
LIMBACH, Alan, A.; US
HWANG, Pamela, E.; US
JACKSON, Blake; US
Prioritätsdaten:
62/434,30014.12.2016US
Titel (EN) METHODS FOR ASSEMBLING DNA MOLECULES
(FR) PROCÉDÉS D’ASSEMBLAGE DE MOLÉCULES D’ADN
Zusammenfassung:
(EN) The invention provides compositions and methods for assembling a DNA molecule having a desired sequence. The methods involve contacting a DNA polymerase, dNTPs, and a plurality of pairs of oligonucleotides. The oligonucleotides of a pair have a portion of the desired sequence, and an internal sequence that overlaps and is complementary to an internal sequence of the other oligonucleotide of the pair, and, when arranged in order, they have at least a portion of the desired sequence. The oligonucleotides also have a 3' or a 5' primer binding sequence having a binding site for a primer. The oligonucleotides that correspond to the end oligonucleotides of the desired sequence also have a universal 3' flanking sequence and a universal 5' flanking sequence, respectively. The methods involve performing a first amplification reaction on the plurality of pairs of oligonucleotides; removing the 3' and 5' primer binding sequences from the plurality of pairs of oligonucleotides; and subjecting the plurality of pairs of oligonucleotides to an assembly reaction to thereby assemble the dsDNA molecule having the desired sequence.
(FR) La présente invention concerne des compositions et des procédés d’assemblage d’une molécule d’ADN présentant une séquence souhaitée. Les procédés consistent à mettre en contact une ADN polymérase, des dNTP, et une pluralité de paires d’oligonucléotides. Les oligonucléotides d’une paire présentent une partie de la séquence souhaitée, et une séquence interne qui chevauche et qui est complémentaire d’une séquence interne de l’autre oligonucléotide de la paire, et, lorsque disposées dans l’ordre, elles possèdent au moins une partie de la séquence souhaitée. Les oligonucléotides possèdent également une séquence de liaison d’amorce (3’) ou (5’) ayant un site de liaison pour une amorce. Les oligonucléotides qui correspondent aux oligonucléotides terminaux de la séquence souhaitée possèdent respectivement également une séquence flanquante (3’) universelle et une séquence flanquante (5’) universelle. Les procédés consistent à effectuer une première réaction d’amplification sur la pluralité de paires d’oligonucléotides ; à éliminer les séquences de liaison d’amorce (3’) et (5’) de la pluralité des paires d’oligonucléotides ; et à soumettre la pluralité des paires d’oligonucléotides à une réaction d’assemblage pour assembler ainsi la molécule d’ADNdb possédant la séquence souhaitée.
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Veröffentlichungssprache: Englisch (EN)
Anmeldesprache: Englisch (EN)