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1. (WO2017214379) SIMULATING LIVING CELL IN SILICO
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Veröff.-Nr.: WO/2017/214379 Internationale Anmeldenummer PCT/US2017/036526
Veröffentlichungsdatum: 14.12.2017 Internationales Anmeldedatum: 08.06.2017
IPC:
C12M 1/36 (2006.01) ,C12M 1/34 (2006.01)
C Chemie; Hüttenwesen
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Biochemie; Bier; Spirituosen; Wein; Essig; Mikrobiologie; Enzymologie; Mutation oder genetische Techniken
M
Vorrichtungen für Enzymologie oder Mikrobiologie
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Vorrichtungen für Enzymologie oder Mikrobiologie
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einschließlich einer Steuerung abhängig von Verfahrensbedingungen oder Zeit, z.B. automatisch gesteuerte Gärvorrichtungen
C Chemie; Hüttenwesen
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Biochemie; Bier; Spirituosen; Wein; Essig; Mikrobiologie; Enzymologie; Mutation oder genetische Techniken
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Vorrichtungen für Enzymologie oder Mikrobiologie
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Vorrichtungen für Enzymologie oder Mikrobiologie
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Messen oder Untersuchen mit Einrichtungen zum Messen oder Wahrnehmen der Verfahrensbedingungen, z.B. Koloniezähler
Anmelder:
X DEVELOPMENT LLC [US/US]; 1600 Amphitheatre Parkway Mountain View, CA 94043, US
Erfinder:
THOUPPAURACHCHI, Chirath; US
PEIKON, Ian; US
THOMPSON, Jason; US
SPALINK, Tammo; US
Vertreter:
RELLINGER, Benjamin, Addison; US
Prioritätsdaten:
15/177,04708.06.2016US
Titel (EN) SIMULATING LIVING CELL IN SILICO
(FR) SIMULATION DE CELLULE VIVANTE IN SILICO
Zusammenfassung:
(EN) The behavior and/or internal activities of a microorganism can be simulated using a model of the microorganism. Such simulations can be used to determine the efficacy of treatments, disinfectants, antibiotics, chemotherapies, or other methods of interacting with the microorganism, or to provide some other information about the microorganism. Systems and methods are provided herein for fitting, refining, or otherwise improving such models in an automated fashion. Such systems and methods include performing whole-cell experiments to determine a correspondence between the predictions of such models and the actual behavior of samples of the microorganism. Such systems and methods also include, based on such determined correspondences, directly assessing determined discrete sets of properties of the microorganism and/or of constituents of the microorganism and updating parameters of the model corresponding to the properties of the discrete set such that the overall accuracy of the model is improved.
(FR) La présente invention décrit le comportement et/ou les activités internes d’un micro-organisme pouvant être simulés à l'aide d'un modèle du micro-organisme. De telles simulations peuvent être utilisées en vue de déterminer l’efficacité des traitements, des désinfectants, des antibiotiques, des chimiothérapies, ou d’autres procédés d’interaction avec le micro-organisme, ou en vue de fournir certaines autres informations sur le micro-organisme. Les systèmes et les procédés sont décrits ici pour l’ajustement, l’affinage, ou sinon l’amélioration de tels modèles d’une manière automatisée. De tels systèmes et procédés comprennent l’exécution d’expérimentations sur des cellules entières en vue de déterminer une correspondance entre les prédictions de tels modèles et le comportement réel des échantillons du micro-organisme. De tels systèmes et procédés comprennent également, sur la base de telles correspondances déterminées, l’évaluation directement déterminée d’ensembles discrets de propriétés du micro-organisme et/ou des constituants du micro-organisme et la mise à jour des paramètres du modèle correspondant aux propriétés de l’ensemble discret de sorte que la précision globale du modèle soit améliorée.
front page image
Designierte Staaten: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
African Regional Intellectual Property Organization (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasische Patentorganisation (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Europäisches Patentamt (EPO) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Veröffentlichungssprache: Englisch (EN)
Anmeldesprache: Englisch (EN)