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1. WO2011069501 - KOMPETITIONSASSAY ZUR DETEKTION VON NUKLEINSÄUREOLIGOMER-HYBRIDISIERUNGSEREIGNISSEN

Veröffentlichungsnummer WO/2011/069501
Veröffentlichungsdatum 16.06.2011
Internationales Aktenzeichen PCT/DE2010/075152
Internationales Anmeldedatum 03.12.2010
IPC
C12Q 1/68 2006.01
CSektion C Chemie; Hüttenwesen
12Biochemie; Bier; Spirituosen; Wein; Essig; Mikrobiologie; Enzymologie; Mutation oder genetische Techniken
QMess- oder Untersuchungsverfahren unter Einbeziehung von Enzymen, Nukleinsäuren oder Mikroorganismen; Zusammensetzungen oder Testpapiere hierfür; Verfahren zum Herstellen derartiger Zusammensetzungen; Steuern in Abhängigkeit von den Verfahrensbedingungen bei mikrobiologischen oder enzymologischen Verfahren
1Messverfahren oder Untersuchungsverfahren unter Einbeziehung von Enzymen, Nukleinsäuren oder Mikroorganismen; Zusammensetzungen hierfür; Verfahren zum Herstellen derartiger Zusammensetzungen
68unter Einbeziehung von Nucleinsäuren
CPC
C12Q 1/6825
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6813Hybridisation assays
6816characterised by the detection means
6825Nucleic acid detection involving sensors
C12Q 1/6837
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6813Hybridisation assays
6834Enzymatic or biochemical coupling of nucleic acids to a solid phase
6837using probe arrays or probe chips
Anmelder
  • FRIZ BIOCHEM GESELLSCHAFT FÜR BIOANALYTIK MBH [DE]/[DE] (AllExceptUS)
  • HARTWICH, Gerhard [DE]/[DE] (UsOnly)
Erfinder
  • HARTWICH, Gerhard
Vertreter
  • GRAF GLÜCK HABERSACK KRITZENBERGER
Prioritätsdaten
10 2009 044 795.407.12.2009DE
Veröffentlichungssprache Deutsch (DE)
Anmeldesprache Deutsch (DE)
Designierte Staaten
Titel
(DE) KOMPETITIONSASSAY ZUR DETEKTION VON NUKLEINSÄUREOLIGOMER-HYBRIDISIERUNGSEREIGNISSEN
(EN) COMPETITION ASSAY FOR DETECTING NUCLEIC ACID OLIGOMER HYBRIDIZATION OCCURRENCES
(FR) ESSAI DE COMPÉTITION POUR DÉTECTER DES ÉVÉNEMENTS D'HYBRIDATION D'OLIGOMÈRES D'ACIDE NUCLÉIQUE
Zusammenfassung
(DE)
Beschrieben wird ein Verfahren zur Detektion von Nukleinsäureoligomer-Hybridisierungsereignissen umfassend die Schritte Bereitstellen einer modifizierten Oberfläche, wobei die Modifikation in der Anbindung wenigstens einer Art von Sonden-Nukleinsäureoligomeren besteht, Bereitstellen einer Probe mit Target-Nukleinsäureoligomeren, Bereitstellen einer Lösung mit wenigstens einer Art von Signal-Nukleinsäureoligomeren, wobei die Signal-Nukleinsäureoligomere mit zumindest einem Detektionslabel modifiziert sind, die Signal-Nukleinsäureoligomere einen zu den Sonden-Nukleinsäureoligomeren komplementären oder weitgehend komplementären Abschnitt besitzen und die Signal-Nukleinsäureoligomere einen zu den Target-Nukleinsäureoligomeren komplementären oder weitgehend komplementären Abschnitt besitzen, Bereitstellen einer Reaktionslösung zur Durchführung einer Nukleinsäureamplifikation, wobei die Reaktionslösung zumindest Nukleotide und wenigstens eine Art von Nukleinsäure-Polymerase enthält, Vermischen und Inkontaktbringen mit der modifizierten Oberfläche von der Lösung mit Signal-Nukleinsäureoligomeren, der Probe mit Target-Nukleinsäureoligomeren und der Reaktionslösung zur Durchführung einer Nukleinsäureamplifikation, wobei die Signal-Nukleinsäureoligomere in dem hergestellten Gemisch in einer Konzentration von 10-17 mol/l bis 10-3 mol/l vorliegen und die Target-Nukleinsäureoligomere in dem hergestellten Gemisch in einer Konzentration von bis zu 10-7 mol/l vorliegen, erste Detektion der Signal-Nukleinsäureoligomere durch eine oberflächensensitive Methode, Amplifizierung der Target-Nukleinsäureoligomere mittels Nukleinsäureamplifikation, zweite Detektion der Signal-Nukleinsäureoligomere durch eine oberflächensensitive Methode und Vergleich der bei der ersten Detektion der Signal-Nukleinsäureoligomere erhaltenen Werte mit den bei der zweiten Detektion der Signal-Nukleinsäureoligomere erhaltenen Werte.
(EN)
The invention relates to a method for detecting nucleic acid oligomer hybridization occurrences comprising the steps of providing a modified surface, wherein the modification consists of the bonding of at least one type of probe nucleic acid oligomer, providing a sample having target nucleic acid oligomers, providing a solution having at least one type of signal nucleic acid oligomers, wherein signal nucleic acid oligomers are modified with at least one detection label, the signal nucleic acid oligomers have a section that is complementary or substantially complementary to the probe nucleic acid oligomers, and the signal nucleic acid oligomers have a section that is complimentary or substantially complementary to the target nucleic acid oligomers, providing a reaction solution for performing a nucleic acid amplification, wherein the reaction solution contains at least nucleotides and at least one type of nucleic acid polymerase, mixing and bringing into contact with the modified surface the solution having signal nucleic acid oligomers, the sample having target nucleic acid oligomers, and the reaction solution for performing a nucleic acid amplification, wherein the signal nucleic acid oligomers are present in the produced mixture in a concentration of 10-17 mol/l to 10-3 mol/l and the target nucleic acid oligomers are present in the produced mixture in a concentration of up to 10-7 mol/l, performing a first detection of the signal nucleic acid oligomers by a surface-sensitive method, amplifying the target nucleic acid oligomers by means of nucleic acid amplification, performing a second detection of the signal nucleic acid oligomers by a surface-sensitive method, and comparing the values obtained in the first detection of the signal nucleic acid oligomers with the values obtained in the second detection of the signal nucleic acid oligomers.
(FR)
L'invention concerne un procédé de détection d'événements d'hybridation d'oligomères d'acide nucléique comprenant les étapes: préparation d'une surface modifiée, la modification consistant à lier au moins un type d'oligomères d'acide nucléique sondes, préparation d'un échantillon avec des oligomères d'acide nucléique cibles, préparation d'une solution avec au moins un type d'oligomères d'acide nucléique signaux, les oligomères d'acide nucléique signaux étant modifiés par au moins une étiquette de détection, les oligomères d'acide nucléique signaux possédant un segment complémentaire ou largement complémentaire des oligomères d'acide nucléique sondes et les oligomères d'acide nucléique signaux possédant un segment complémentaire ou largement complémentaire des oligomères d'acide nucléique cibles, préparation d'une solution de réaction pour effectuer une amplification de l'acide nucléique, la solution de réaction contenant au moins des nucléotides et au moins un type de polymérase d'acide nucléique, mélange et mise en contact avec la surface modifiée de la solution avec des oligomères d'acide nucléique, de l'échantillon avec des oligomères d'acide nucléique cibles et de la solution de réaction pour effectuer une amplification de l'acide nucléique, les oligomères d'acide nucléiques signaux étant présents dans le mélange produit à une concentration de 10-17 moles/l à 10-3 moles/l et les oligomères d'acide nucléique cibles étant présents dans le mélange produit à une concentration de 10-7 moles/l, première détection des oligomères d'acide nucléique signaux par une méthode sensible à la surface, amplification des oligomères d'acide nucléique cibles au moyen d'une amplification de l'acide nucléique, deuxième détection des oligomères d'acide nucléiques signaux par une méthode sensible à la surface et comparaison des valeurs obtenues lors de la première détection des oligomères d'acide nucléique signaux avec les valeurs obtenues lors de la deuxième détection des oligomères d'acide nucléique signaux.
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