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1. (WO2003057909) VERFAHREN ZUM NACHWEIS VON CYTOSIN−METHYLIERUNGSMUSTERN DURCH EXPONENTIELLE LIGATION HYBRIDISIERTER SONDENOLIGONUKLEOTIDE (MLA)
Aktuellste beim Internationalen Büro vorliegende bibliographische Daten   

TranslationÜbersetzung: Original-->Deutsch
Veröff.-Nr.:    WO/2003/057909    Internationale Anmeldenummer    PCT/DE2003/000073
Veröffentlichungsdatum: 17.07.2003 Internationales Anmeldedatum: 08.01.2003
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01)
Anmelder: EPIGENOMICS AG [DE/DE]; Kastanienallee 24 10435 Berlin (DE) (For All Designated States Except US).
BERLIN, Kurt [DE/DE]; (DE) (For US Only)
Erfinder: BERLIN, Kurt; (DE)
Vertreter: SCHUBERT, Klemens; Neue Promenade 5 10178 Berlin-Mitte (DE)
Prioritätsdaten:
102 01 138.9 08.01.2002 DE
Titel (DE) VERFAHREN ZUM NACHWEIS VON CYTOSIN−METHYLIERUNGSMUSTERN DURCH EXPONENTIELLE LIGATION HYBRIDISIERTER SONDENOLIGONUKLEOTIDE (MLA)
(EN) METHOD FOR DETECTING CYTOSINE-METHYLATION PATTERNS BY EXPONENTIAL LIGATION OF HYBRIDISED PROBE OLIGO-NUCLEOTIDES (MLA)
(FR) PROCEDE DE DETECTION DE MODELES DE METHYLATION DE LA CYTOSINE PAR LIGATION EXPONENTIELLE D'OLIGONUCLEOTIDES SONDES HYBRIDES (MLA)
Zusammenfassung: front page image
(DE)Beschrieben wird ein Verfahren zum Nachweis von Cytosin−Methylierung in DNA−Proben, das aus den folgenden Schritten besteht: Zuerst wird eine genomische DNA−Probe, welche zu untersuchende DNA und Hintergrund−DNA umfasst, chemisch derart behandelt, dass alle nicht methylierten Cytosinbasen in Uracil umgewandelt werden, während die 5−Methylcytosinbasen unverändert bleiben. Dann wird die chemisch behandelte DNA−Probe unter Verwendung von mindestens 2 Primeroligonukleotiden sowie einer Polymerase amplifiziert, wobei die zu untersuchende DNA gegenüber der Hintergrund−DNA als Templat bevorzugt wird und im letzten Schritt werden die Amplifikate analysiert und aus dem Vorliegen eines Amplifikates und/oder aus der Analyse weiterer Positionen auf den Methylierungsstatus in der zu untersuchenden DNA geschlossen.
(EN)The invention relates to a method for detecting cytosine-methylation in DNA samples which consists of the following steps: firstly, a genomic DNA sample, which comprises background DNA and DNA which is to be examined, is chemically treated in such a way that all non-methylated cytosine bases are converted into uracil, whereby the 5-methyl cytosine bases remain unchanged. The DNA sample which has been chemically treated is then amplified by using at least 2 primer-oligo-nucleotides and a polymerase, the DNA which is to be examined with respect to the background DNA is preferred as a template. In the final step, the amplificates are analysed and on the basis of the presence of an amplificate and/or from the analysis of further positions information on the methylation status is deduced in the DNA which is to be examined.
(FR)Procédé de détection de la méthylation de la cytosine dans des échantillons d'ADN, qui consiste d'abord à traiter chimiquement un échantillon d'ADN génomique comportant de l'ADN à étudier et de l'ADN de fond de manière telle que toutes les bases cytosine non méthylées sont transformées en uracile, tandis que les bases 5-méthylcytosine restent inchangées. Ensuite, l'échantillon d'ADN traité chimiquement est amplifié à l'aide d'au moins deux amorces oligonucléotidiques et d'une polymérase. L'ADN à étudier est préféré en tant que matrice à l'ADN de fond. Dans l'étape finale, les produits d'amplification sont analysés et l'état de méthylation de l'ADN à étudier est déduit à partir de la présence d'un produit d'amplification et / ou à partir de l'analyse d'autres positions.
Designierte Staaten: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DK, DM, DZ, EC, EE, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NO, NZ, OM, PH, PL, PT, RO, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, YU, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (GH, GM, KE, LS, MW, MZ, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE, SI, SK, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Veröffentlichungssprache: German (DE)
Anmeldesprache: German (DE)